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Proyecto

Red Genómica para el estudio de poblaciones de microorganismos patógenos que afectan los frutales de Prunus: Nemátodos agalladores y Pseudomona syringae

Rubro Varios Rubros Agrícolas
Dependencia Rayentue - Rengo
Duración Desde 01-01-2019 Hasta 31-12-2021
Encargado (a) Boris Sagredo Diaz

Equipo de Trabajo

Objetivo General

Desarrollar una plataforma en red con datos genómicos y herramientas de análisis para estudiar la variabilidad genética de las poblaciones de nematodos agalladores (Meloidogyne spp) y Pseudomonas syringae que afectan los frutales de Prunus en Chile, para facilitar el desarrollo de herramientas de identificación de variantes (y/o especies) que faciliten estudios epidemiológicos para su control.

Objetivos Específicos

  • 1) Desarrollar capacidades de red (comunicación, análisis y respaldo de datos) para análisis bioinformáticos a través de la Red de Internet INIA, accesible para los investigadores del núcleo y todos los investigadores del INIA que requieren apoyo en el área genómica.
  • 2) Determinar la variabilidad genética de las poblaciones de Pseudomonas syringae asociadas al cáncer bacterial en Prunus a nivel nacional, en función de polimorfismos de ADN, nivel de resistencia a Cu+2 y presencia de genes de resistencia a Cu+2
  • 3) Establecer el nivel de similitud/disimilitud de Meloidogyne ethiopica con otros genomas del genero Meloidogyne secuenciados, para inferir sobre su posible origen e identificar marcadores moleculares (i.e. SSR) útiles para estudios poblacionales.
  • 4) Desarrollar y validar herramientas moleculares de identificación de variantes genéticas asociados a patovares y/o especies, para P. syringae y Meloidogyne spp, respectivamente, para apoyar estudios epidemiológicos de control de estos patógeno y plaga, respectivamente.

Presentaciones en Congresos

  • Correa F, Beltrán F, Lemus G, Osorio V, Milla P, France A, Sagredo B (2019). Estudios genómicos para desarrollar pruebas HRM-qPCR para identificar y estudiar las poblaciones de Pseudomonas syringae agente causal del cáncer bacterial en cerezos. Encuentro Anual U-Genoma 23 julio 2019. Santiago. https://ugenoma.cl/2019/finaliza-exitosamente-encuentro-anual-u-genoma-2019/ (2019)

Palabras Clave