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Proyecto

From QTLs to QTNs: Identifying the most favorable alleles for assisted selection of quality traits in table grapes and their interaction with growth regulators, N°1170586

Rubro Vid de mesa
Dependencia La Platina - Santiago
Duración Desde 01-01-2018 Hasta 31-03-2021
Encargado (a) Nilo Mejia .

Equipo de Trabajo

Objetivo General

El objetivo principal del proyecto es validar los QTLs recientemente identificados (FONDEF G09i1007) para los atributos prioritarios en uva de mesa y de interés para el Programa de Mejoramiento Genético de Uva de Mesa (tamaño de baya, firmeza y textura). Además, analizar las interacciones de estos QTLS, a nivel genético, con las respuestas a la aplicación de reguladores de crecimiento que afectan la calidad en cosecha y postcosecha. El objetivo de validar los QTLs identificados es poder desarrollar marcadores intragénicos para poder identificar los alelos más frecuentes dentro de los genes candidatos y en base a su evaluación determinar cuales son los alelos favorables para el desarrollo de nuevas variedades. 3.- To assess, at genetic and physiological level, interactions between QTLs for quality-related traits (bunch weight, berry size, firmness and texture) and exogenous growth regulators.

Objetivos Específicos

  • Identificar los alelos más comunes de Genes Candidatos Posicionales (genes candidatos identificados dentro de los intervalos de confianza de los QTLS) a partir de material local y extranjero que represente diversidad genética.
  • Definir los alelos más favorables evaluando la asociación genotipo-fenotipo en pequeñas familias derivadas de material de mejoramiento
  • Identificar, a nivel genético y fisiológico, las interacciones entre los QTLs asociados a atributos de calidad de la baya (tamaño de racimo, tamaño de baya, firmeza y textura) y la aplicación de reguladores de crecimiento exógenos
  • A partir de los objetivos anteriores definir un modelo de selección asistida en base a un panel de marcadores validados.

Publicaciones

  1. Sci Rep. 2018 Jul 31;8(1):11467. doi: 10.1038/s41598-018-29829-1. The transcriptional factor ZEB1 represses Syndecan 1 expression in prostate cancer. Farfán N, Ocarez N, Castellón EA, Mejía N, de Herreros AG, Contreras HR. https://doi.org/10.1038/s41598-018-29829-1 (2018)
  2. Genética de caracteres con impacto organoléptico en la baya y el vino: Caracterización de QTLs para acidez total, pH y color de la piel en vides. Memoria del XVI Congreso Latinoamericano de Viticultura y Enología, Noviembre 2019, Ica, Perú. (2019)
  3. Ocarez, N.; Jiménez, N.; Núñez, R.; Perniola, R.; Marsico, A.D.; Cardone, M.F.; Bergamini, C.; Mejía, N. Unraveling the Deep Genetic Architecture for Seedlessness in Grapevine and the Development and Validation of a New Set of Markers for VviAGL11-Based Gene-Assisted Selection. Genes 2020, 11, 151. (2020)
  4. García R. Miguel, Barba B. Paola y Sellés V. Gabriel. 2020.Investigación y desarrollo en vides. Santiago, Chile. Instituto de Investigaciones Agropecuarias, INIA. 56p. (2020)

Presentaciones en Congresos

  • Expositor en 2º encuentro científico "biología vegetal y biotecnología", 23 al 24 de julio 2018, espacio bicentenario, Talca. Presentación oral: "Revelando las bases genéticas y transcriptómicas del ablandamiento de bayas en vides". http://biologia.utalca.cl/encuentro-cientifico-2018/ (2018)
  • IDENTIFICATION OF QUANTITATIVE TRAIT GENES COMBINING GLOBAL GENE EXPRESSION ANALYSIS AND ASSOCIATION ANALYSIS FOR BERRY SIZE AND TEXTURAL PROPERTIES IN GRAPEVINE. Iquique, Octubre de 2019. XLII reunión anual de la Sociedad de Bioquímica y Biología Molecular de Chile (SBBMCh)/ XIV reunión anual de la Sociedad de Biología Vegetal de Chile (CSPB) (2019)
  • Berry Size Genetic Architecture Revealed by Fine and Exhaustive QTL Mapping Analysis Nilo Mejía, Nallatt Ocarez, Nicolás Jiménez, Reynaldo Núñez and Jorge Lagrèze 9th International Table Grape Symposium between 16th and 21st of February, 2020 in Casa Piedra, Santiago. (2020)
  • Identification of quantitative trait genes using global gene expression analysis and fine QTL analysis for berry textural properties in table grapes Reynaldo Núñez, Nallatt Ocarez, Nicolás Jiménez, Jorge Lagrèze, Diego Osorio, Vicente Salas, Bruno Defilippi and Nilo Mejía 9th International Table Grape Symposium between 16th and 21st of February, 2020 in Casa Piedra, Santiago. (2020)

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